T-COFFEE, Version_11.00 (Version_11.00)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=1000
*
 BAD AVG GOOD
*
sequence1   : 100
sequence2   : 100
1cms        : 100
sequence4   : 100
4pep        : 100
cons        : 100

sequence1   -STGSATTTPIDS-L-DDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGS-SSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFD
sequence2   AASGVATNTPTAN---DEEYITPVTIG--GTTLNLNFDTGSADLWVFSTELPASQQSGHSVYNP--SATGKELSGYTWSISYGDGS-SASGNVFTDSVTVGGVTAHGQAVQAAQQISAQFQQDTNNDGLLGLAFSSINTVQPQSQTTFFD
1cms        ---GEVASVPLTNYL-DSQYFGKIYLGTPPQEFTVLFDTGSSDFWVPSIYCKSNACKNHQRFDPRKSSTFQNL-GKPLSIHYGTGS-MQ-GILGYDTVTVSNIVDIQQTVGLSTQEPGDVFTYAEFDGILGMAYPSLAS---EYSIPVFD
sequence4   ---AGVGTVPMTDYGNDIEYYGQVTIGTPGKKFNLDFDTGSSDLWIASTLCTNCG-SGQTKYDPNQSSTYQAD-GRTWSISYGDGSSAS-GILAKDNVNLGGLLIKGQTIELAKREAASFAS-GPNDGLLGLGFDTITT--VRGVKTPMD
4pep        -----IGDEPLENYL-DTEYFGTIGIGTPAQDFTVIFDTGSSNLWVPSVYCSSLACSDHNQFNPDDSSTFEAT-SQELSITYGTGS-MT-GILGYDTVQVGGISDTNQIFGLSETEPGSFLYYAPFDGILGLAYPSISA---SGATPVFD

cons                 *  .   *  *   : :*     :.: *****:::*: *        ..:  : *  *:* :   .   ** ** **    * :  *.* :..:    * .  :   ....      **:**:.: :: :       . :*


sequence1   NA--KASLDSPVFTADL--GYH-APGTYNFGFIDTTA
sequence2   TV--KSSLAQPLFAVAL--KHQ-QPGVYDFGFIDSSK
1cms        NMMNRHLVAQDLFSVYMD-RNG-QESMLTLGAIDPSY
sequence4   NLISQGLISRPIFGVYLGKAKNGGGGEYIFGGYDSTK
4pep        NLWDQGLVSQDLFSVYLS-SNDDSGSVVLLGGIDSSY

cons        .   :  :   :* . :        .   :*  *.: